刘太岗(副教授)

发布者:张程冬发布时间:2024-03-26浏览次数:1557

 

刘太岗——副教授

 

个人基本情况:

刘太岗,男,1982年生,山东泰安人。现为威尼斯wns8885566副教授,硕士生导师。研究方向:机器学习、生物信息学、数学建模等

已发表SCI论文20余篇;主持国家自然科学基金青年项目1项,上海市教委创新项目1项,上海高校青年教师培养资助计划1项,校博士启动基金1项,参与国家自然科学基金面上项目2项;入选2018年上海高水平地方高校战略创新团队。

 

主要研究方向:

1)机器学习基础理论算法及其在生物医学大数据建模中的应用;

2)水产动物基因组数据挖掘及数据库整合开发(与生命学院陈良标教授团队联合培养);

3)生物信息学分析。

 

主持科研项目:

(1) 国家自然科学基金青年项目,11601324,基于多源信息融合的蛋白酶裂解位点预测算法研究,2016/01-2019/12,结题,主持

(2) 上海市教委创新项目,13YZ098,蛋白酶裂解位点预测的生物信息学方法研究,2013/01-2015/12,结题,主持。

(3) 上海高校青年教师培养资助计划,ZZhy12028,基于信息融合的蛋白质相互作用预测方法研究,2013/01-2014/12,结题,主持。

(4) 国家自然科学基金面上项目,41376135,洋山深水港病毒生物多样性的宏基因组学研究,2014/01 - 2017/12,结题,主要参与人。

(5) 国家自然科学基金面上项目,31570112,藻类巨病毒噬病毒体(Virophage)的发现与鉴定,2016/01 - 2019/12,结题,主要参与人。

 

发表学术论文:

[1] Ding C, Han H, Li, Q, Yang X, and Liu T*, iT3SE-PX: Identification of Bacterial Type III Secreted Effectors Using PSSM Profiles and XGBoost Feature Selection, Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2021, doi: 10.1155/2021/6690299. (SCI, 第一作者为2019级研究生)

[2] Yang Y, Zheng H, Wang C, Xiao W, Liu T*, Predicting Apoptosis Protein Subcellular Locations based on the Protein Overlapping Property Matrix and Tri-Gram Encoding, Int J Mol Sci, 2019, 20(9), doi: 10.3390/ijms20092344. (SCI, 第一作者为2015级本科生,保送南京大学)

[3] Xiuzhi Sang, Wanyue Xiao, Huiwen Zheng, Yang Yang, and Taigang Liu*, HMMPred: Accurate Prediction of DNA-Binding Proteins Based on HMM Profiles and XGBoost Feature Selection, Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2020, doi: 10.1155/2020/1384749. (SCI, 第一作者为2018级研究生)

[4] Jun Wang, Huiwen Zheng, Yang Yang, Wanyue Xiao, and Taigang Liu*, PredDBP-Stack: Prediction of DNA-Binding Proteins from HMM Profiles using a Stacked Ensemble Method, BioMed Research International, 2020, doi: 10.1155/2020/7297631. (SCI,第一作者为2017级本科生,保送浙江大学)

[5] Peiying Tao, Taigang Liu*, Xiaowei Li, Lanming Chen*, Prediction of protein structural class using tri-gram probabilities of position-specific scoring matrix and recursive feature elimination, Amino Acids, 2015, 47: 461-468. (SCI,第一作者为联合培养食品学院研究生)

[6] Xiaowei Li, Taigang Liu*, Peiying Tao, Chunhua Wang, Lanming Chen*, A highly accurate protein structural class prediction approach using auto cross covariance transformation and recursive feature elimination, Computational Biology and Chemistry, 2015, 59: 95-100. (SCI,第一作者为联合培养食品学院研究生)

[7] Taigang Liu, Yufang Qin, Yongjie Wang*, Chunhua Wang*, Prediction of protein structural class based on gapped-dipeptides and a recursive feature selection approach, International Journal of Molecular Sciences, 2016, 17: 1. SCI

[8] Taigang Liu, Peiying Tao, Xiaowei Li, Yufang Qin, Chunhua Wang*, Prediction of subcellular location of apoptosis proteins combining tri-gram encoding based on PSSM and recursive feature elimination, Journal of Theoretical Biology, 2015, 366: 8-12. SCI

[9] Taigang Liu, Xingbo Geng, Xiaoqi Zheng*, Rensuo Li, Jun Wang, Accurate prediction of protein structural class using auto covariance transformation of psi-blast profiles, Amino Acids, 2012, 42: 2243-2249. SCI

[10] Taigang Liu, Xiaoqi Zheng, Jun Wang*, Prediction of protein structural class using a complexity-based distance measure, Amino Acids, 2010, 38: 721-728. SCI

[11] Taigang Liu, Xiaoqi Zheng*, Jun Wang, Prediction of protein structural class for low-similarity sequences using support vector machine and psi-blast profile, Biochimie, 2010, 92: 1330-1334. SCI

[12] Taigang Liu, Xiaoqi Zheng*, Chunhua Wang, Jun Wang, Prediction of subcellular location of apoptosis proteins using pseudo amino acid composition: An approach from auto covariance transformation, Protein and Peptide Letters, 2010, 17: 1263-1269. SCI

 

获奖情况:

2012年,参加校青年教师讲课比赛获理工组一等奖; (校级)

2012年,上海大学生创新活动计划项目立项,任指导教师; (市级)

2012年,获上海高校青年教师培养资助计划项目资助; (市级)

2013年,获威尼斯wns8885566教学先进个人奖; (院级)

2013年,获上海市教委科研创新项目资助; (市级)

2013年,“首届滴水湖大学生创新活动论坛”获案例交流二等奖,任指导教师; (市级)

2014年,被评为“受学生欢迎的好老师”; (校级)

2014年,校人事考核优秀; (校级)

2015年,被评为“受学生欢迎的好老师”; (校级)

2015年,指导全国大学生数学建模竞赛获上海市一等奖; (级)

2016年,被评为“受学生欢迎的好老师”; (校级)

2016年,《高等数学A》被评为“好课堂”; (校级)

2016年,入选三海人才“海燕计划”; (校级)

2016年,指导全国大学生数学建模竞赛获上海市三等奖; (国家级)

2016年,指导全国大学生数学竞赛获全国二等奖2人次; (国家级)

2016年,威尼斯wns8885566科学成果奖三等奖,排名第三; (校级)

2016年,获国家自然科学基金青年基金项目资助; (国家级)

2017年,指导美国大学生数学建模竞赛获国际二等奖; (国际级)

2017年,指导全国大学生数学建模竞赛获上海市二等奖1项; (国家级)

2017年,指导全国大学生数学竞赛获全国一等奖1项; (国家级)

2017年,被评为“受学生欢迎的好老师”; (校级)

2018年,指导美国大学生数学建模竞赛获国际二等奖; (国际级)

2018年,被评为威尼斯wns8885566“优秀课程导师(班主任)”; (院级)

2018年,被评为“受学生欢迎的好老师”; (校级)

2018年,获“育才奖”;(校级)

2019年,指导全国研究生数学建模竞赛获全国二等奖一项;(国家级)

2019年,获评数学建模优秀教学团队(负责人);(校级)

2020年,被评为“受学生欢迎的好老师”; (校级)

2020年,获教学名师荣誉称号;(校级)

2020年,指导全国研究生数学建模竞赛获全国二等奖1项,三等奖2项。(国家级)

 

教学工作:

《高等数学》、《线性代数》、《概率论与数理统计》、《数学实验与建模》

 

联系方式:

E-mailtgliu@shou.edu.cn

个人主页:https://taigangliu.github.io/

联系地址:上海市浦东新区沪城环路999号,威尼斯wns8885566401

邮编:201306